为确保培训质量，中国疾控中心对CFETP两年制及中级FETP学员实行责任导师、现场导师和项目教师联合指导与管理的机制。中国疾控中心曾先后于2019年、2020年、2021年和2023年4次开展CFETP导师资格遴选，获得CFETP导师资格者聘期为4年。目前，中国疾控中心和省及地方疾控中心共426人具有CFETP导师资格，为2020年、2021年和2023年遴选。中国疾控中心在具有CFETP导师资格的专家中为学员确定责任导师负责全程指导学员。现场导师由培训基地或学员单位确定，负责学员现场实践活动的组织协调和带教指导。CFETP项目教师负责学员培训产出的管理、监督和评估，并提供技术指导。
为加强指导教师队伍建设，中国疾控中心每年举办CFETP指导教师培训班，切实提高导师带教和指导CFETP学员的能力，并对导师开展考核评估。
