中国疾控中心与世卫组织的技术合作历史悠久，领域广泛。从1983年初建中国预防医学中心至今已40余年。合作领域从传染病防控、卫生应急、计划免疫到慢病防控、环境与健康、妇幼健康，烟草控制，以及全球卫生合作等，几乎涵盖了双方关注的所有公共卫生议题。世卫组织对中国疾控事业发展，包括体系建设、技术更新和人才培养等提供了始终如一的技术和资金支持，见证了中国卫生健康事业40年来取得的非凡成就。目前，中国疾控中心与世卫组织的技术交流与项目合作活跃，共同推动《中国—世卫组织国家合作战略（2022-2026）》和《中国—世卫组织关于“一带一路”卫生领域合作的执行计划》的实施。 

　　目前，中国疾控中心有6个世卫组织合作中心，涉及流感、媒介控制、热带病、慢病、职业卫生，辐射与健康和伤害防控；还有5个全球或区域参比实验室，涉及日本脑炎、脊灰、麻疹风疹、轮状病毒、HIV耐药检测；中心是全球疫情警报和反应网络（GOARN）成员，是世卫组织多个全球合作倡议的积极支持者，是世卫组织各类专业技术全球报告的编撰组成员。 　　

　　WHO流感参比和研究合作中心(2010-2026) 

　　WHO媒介生物监测与管理合作中心(2012-2024) 

　　WHO热带病合作中心(2015-2027) 

　　WHO辐射与健康合作中心(2019-2027) 

　　WHO慢性非传染性疾病社区综合防治合作中心(2022-2026) 

　　WHO伤害预防控制合作中心(2024-2028)